More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2212 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  100 
 
 		 170 aa  339  9e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  42.76 
 
 		 182 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  43.45 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  42.76 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  43.45 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  43.45 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  41.61 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  41.98 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  36.77 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 183 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 127 aa  87  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  84.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  34.71 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  34.71 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  33.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  33.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.25 
 
 		 739 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  36.67 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  35.54 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  35 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  40.17 
 
 		 1983 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  34.17 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  34.71 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  33.88 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  34.71 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  34.96 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 396 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.44 
 
 		 2336 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 1010 aa  75.1  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  31.34 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.62 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 1646 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 1646 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  31.54 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  31.54 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 2026 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 1647 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  38.53 
 
 		 2026 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.15 
 
 		 696 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  33.06 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  30.52 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>