More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3241 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  91.71 
 
 		 181 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  84.44 
 
 		 181 aa  328  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  84.62 
 
 		 182 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  81.22 
 
 		 181 aa  316  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  80.66 
 
 		 181 aa  315  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  81.13 
 
 		 162 aa  277  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  49.69 
 
 		 183 aa  181  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 167 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 168 aa  157  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  43.95 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  39.75 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  43.45 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  38.19 
 
 		 157 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  35.1 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  36.69 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 129 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 129 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 129 aa  101  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  34.67 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 129 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  42.02 
 
 		 131 aa  99  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  41.88 
 
 		 129 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  98.6  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 132 aa  98.2  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  39.34 
 
 		 133 aa  97.8  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 127 aa  95.9  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  95.5  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  39.83 
 
 		 129 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 129 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  39.83 
 
 		 129 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  94.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  36.89 
 
 		 134 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  94  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 127 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  37.5 
 
 		 128 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 131 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  36.75 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 129 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 139 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  37.61 
 
 		 148 aa  92  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 131 aa  92  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  91.7  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 131 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 131 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  35.9 
 
 		 127 aa  91.3  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 131 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 123 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 131 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 131 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 131 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 128 aa  91.3  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 132 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 132 aa  91.3  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  35.9 
 
 		 127 aa  90.9  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 135 aa  90.9  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 122 aa  90.5  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  90.5  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  35 
 
 		 127 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 123 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  38.46 
 
 		 131 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  38.46 
 
 		 131 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  38.46 
 
 		 131 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  37.19 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  38.46 
 
 		 131 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 126 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 131 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  38.46 
 
 		 131 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  38.46 
 
 		 131 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 131 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>