More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2214 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  100 
 
 		 165 aa  330  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  49.06 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  48.43 
 
 		 181 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  46.95 
 
 		 182 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  47.8 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  47.8 
 
 		 181 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  43.87 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  46.31 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  44.52 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  41.29 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  35.33 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 183 aa  100  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 197 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  37.91 
 
 		 194 aa  94  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  35.62 
 
 		 228 aa  88.2  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0661  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 887 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3542  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.71 
 
 		 590 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  34.03 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  32.37 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1841  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  33.33 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.89 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.89 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  33.33 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  30.07 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  36.44 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  36.44 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 242 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  37.1 
 
 		 734 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0525  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 277 aa  74.7  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.545244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 247 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  36.8 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  36.36 
 
 		 2301 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 567 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.67 
 
 		 703 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  37.82 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  35.2 
 
 		 248 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.7 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  35.2 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  36.36 
 
 		 2284 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  35.59 
 
 		 568 aa  72  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  37.4 
 
 		 568 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 255 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  37.88 
 
 		 919 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 310 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  38.14 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  38.14 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  29.6 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1058  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000718409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 1066 aa  70.9  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.52 
 
 		 860 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.5 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.52 
 
 		 860 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 1631 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 452 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.9 
 
 		 873 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  32 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  34.59 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  36.43 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  35.59 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  32.26 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 699 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.45 
 
 		 438 aa  68.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 534 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2158  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.693908 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  34.4 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  35.34 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  35.59 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  32.26 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 259 aa  68.2  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1651 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  36.8 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>