More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1980 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  100 
 
 		 126 aa  258  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  44.95 
 
 		 120 aa  95.9  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  43.93 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  39.82 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  38.14 
 
 		 334 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  38.98 
 
 		 334 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  42.45 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  42.45 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  42.45 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  42.45 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  42.45 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  43.59 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.93 
 
 		 333 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  37.07 
 
 		 334 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1983  response regulator receiver  45.98 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.616596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  38.39 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  37.93 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  41.44 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  40.18 
 
 		 381 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 1309 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 338 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  37.74 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  35.4 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  37.74 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  37.74 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  37.74 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  37.74 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  35.4 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  34.78 
 
 		 208 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 318 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  38.68 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  39.29 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.82 
 
 		 457 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 456 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  40.87 
 
 		 344 aa  78.2  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.54 
 
 		 342 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  37.17 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  37.07 
 
 		 334 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1350 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  39.29 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  39.81 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 560 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  35.04 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.4 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.13 
 
 		 456 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 915 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 538 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 376 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.77 
 
 		 950 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.13 
 
 		 456 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  38.14 
 
 		 1179 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 636 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  35.4 
 
 		 331 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.38 
 
 		 696 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 413 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 406 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 331 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>