More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01457 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01457  response regulator  100 
 
 		 121 aa  241  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  52.89 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  51.24 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  44.92 
 
 		 344 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  43.8 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  46.85 
 
 		 334 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  44.17 
 
 		 334 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  44.07 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  44.07 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  42.74 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  45 
 
 		 330 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  42.5 
 
 		 334 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 338 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.26 
 
 		 331 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 346 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  47.79 
 
 		 331 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.5 
 
 		 335 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  38.84 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.88 
 
 		 333 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  42.02 
 
 		 122 aa  90.5  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  38.02 
 
 		 331 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.02 
 
 		 331 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 331 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 331 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 331 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 331 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 331 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 331 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 331 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  37.19 
 
 		 331 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 331 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  40.83 
 
 		 376 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.98 
 
 		 331 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  41.18 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  41.18 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  41.18 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  41.18 
 
 		 184 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  41.18 
 
 		 208 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  42.02 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  42.02 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  41.18 
 
 		 208 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  42.02 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.36 
 
 		 331 aa  87.4  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  41.18 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  42.02 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  42.02 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  35.9 
 
 		 344 aa  84.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.17 
 
 		 342 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  41.23 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  38.26 
 
 		 322 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 331 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  43.59 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.99 
 
 		 229 aa  80.1  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  42.57 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  33.91 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0751  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 485 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0880271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  37.96 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  38.61 
 
 		 339 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 801 aa  70.1  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2741  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 474 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0363909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 868 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3764  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.105051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2160  two component signal transduction response regulator  36.04 
 
 		 451 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000278347  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 737 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  33.94 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  36.52 
 
 		 845 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  37.84 
 
 		 845 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 827 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.26 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 946 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.38 
 
 		 738 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 847 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>