More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1201 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0678  response regulator  100 
 
 
122 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  100 
 
 
122 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  100 
 
 
122 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  99.18 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  99.18 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  93.44 
 
 
122 aa  226  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  63.64 
 
 
122 aa  167  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  62.81 
 
 
122 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  64.46 
 
 
122 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  62.81 
 
 
122 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  63.64 
 
 
122 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  63.64 
 
 
122 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  63.64 
 
 
122 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  62.81 
 
 
122 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  62.81 
 
 
122 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  60.33 
 
 
122 aa  157  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  62.81 
 
 
208 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  62.81 
 
 
122 aa  156  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  62.81 
 
 
122 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  62.81 
 
 
208 aa  156  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  62.81 
 
 
122 aa  156  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  62.81 
 
 
184 aa  156  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  58.68 
 
 
122 aa  151  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  62.93 
 
 
117 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  60.83 
 
 
335 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  57.38 
 
 
331 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  56.67 
 
 
331 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  59.17 
 
 
331 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  55.83 
 
 
331 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  58.33 
 
 
331 aa  144  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  55.83 
 
 
331 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  55.83 
 
 
331 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  55.83 
 
 
331 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  55.83 
 
 
331 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  55.83 
 
 
331 aa  140  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  55.83 
 
 
331 aa  140  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  55.83 
 
 
331 aa  140  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  55.83 
 
 
331 aa  140  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  55.83 
 
 
331 aa  140  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  57.5 
 
 
331 aa  140  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  55.83 
 
 
121 aa  140  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  51.69 
 
 
334 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  51.69 
 
 
334 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.17 
 
 
333 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  47.93 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  44.63 
 
 
338 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  47.5 
 
 
121 aa  114  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  49.04 
 
 
339 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.67 
 
 
330 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.76 
 
 
342 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  47.5 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  44.63 
 
 
346 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  48.28 
 
 
331 aa  103  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  43.97 
 
 
117 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  43.97 
 
 
334 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  44.83 
 
 
334 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  36.97 
 
 
344 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  47.83 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  39.83 
 
 
322 aa  95.9  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  43.1 
 
 
334 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  39.17 
 
 
344 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  38.33 
 
 
132 aa  90.9  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  42.24 
 
 
327 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  42.02 
 
 
121 aa  87  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  40.19 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  42.45 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  40.95 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  41.28 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  38.89 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  37.07 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  36.21 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  36.21 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  40 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1803  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  36.21 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  36.21 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  34.82 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  36.21 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  36.21 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  36.21 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  36.21 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  35.14 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.26 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.35 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  35.14 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1770  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.15 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  32.14 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  35.9 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  38.39 
 
 
280 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1847  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.44 
 
 
372 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705767  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>