More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0334 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  250  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  38.18 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  42.06 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  34.21 
 
 		 406 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 1309 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  35.25 
 
 		 208 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  35.25 
 
 		 208 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  35.25 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  35.25 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  35.25 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  35.25 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  35.25 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  32.04 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  34.55 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  35.29 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 321 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 1066 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 		 1180 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  32.14 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  32.14 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.58 
 
 		 456 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  33.04 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  32.14 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  32.14 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  32.14 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 383 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 376 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 118 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  32.71 
 
 		 120 aa  67  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2039  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 476 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.67 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 1013 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1287 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 		 513 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2841  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1693  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  32.73 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0897  response regulator receiver domain-containing protein  35.24 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.91 
 
 		 709 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.76 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 456 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  34.26 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.4 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0648  protein-glutamate methylesterase  34.51 
 
 		 372 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  35.4 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  34.26 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  35 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 457 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3035  response regulator receiver domain-containing protein  28.44 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1202  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  34.58 
 
 		 349 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 298 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.58 
 
 		 460 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 887 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  32.71 
 
 		 368 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>