More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003520 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  100 
 
 		 344 aa  698    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  84.57 
 
 		 322 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  44.07 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  33.53 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 346 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  33.53 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  34.38 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  32.62 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  35.2 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  31.94 
 
 		 344 aa  178  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  35.38 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.94 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.12 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.73 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.56 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.63 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  27.75 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  30.82 
 
 		 331 aa  159  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.84 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  29.1 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  29.28 
 
 		 331 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  31.08 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  30 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  30 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  30 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  30 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.37 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.15 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  28.96 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  38.52 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  38.52 
 
 		 208 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  38.52 
 
 		 184 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  41.18 
 
 		 122 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  41.18 
 
 		 122 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  41.18 
 
 		 122 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 122 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  41.38 
 
 		 117 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  41.18 
 
 		 122 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 122 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 122 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 122 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 121 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  36.97 
 
 		 122 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  27.92 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  36.97 
 
 		 122 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  36.97 
 
 		 122 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  36.97 
 
 		 122 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  36.97 
 
 		 122 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  36.97 
 
 		 122 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  37.07 
 
 		 132 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 120 aa  90.5  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  39.66 
 
 		 117 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  35.9 
 
 		 121 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  41.12 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  38.39 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  37.29 
 
 		 121 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2738  response regulator receiver domain-containing protein  34.84 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000186206  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.76 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.67 
 
 		 957 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 119 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  36.13 
 
 		 120 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  32.79 
 
 		 128 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 737 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 120 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 125 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 121 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 125 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 935 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  31.4 
 
 		 641 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.71 
 
 		 957 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.71 
 
 		 949 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.71 
 
 		 949 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  32.26 
 
 		 949 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  31.36 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.43 
 
 		 934 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.26 
 
 		 933 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  32.26 
 
 		 933 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  31.15 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.33 
 
 		 949 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.33 
 
 		 949 aa  72.8  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.33 
 
 		 949 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.33 
 
 		 949 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>