More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4223 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  100 
 
 		 321 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.84 
 
 		 209 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.84 
 
 		 209 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.86 
 
 		 208 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  50 
 
 		 125 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  50 
 
 		 125 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 119 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  27.38 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.81 
 
 		 199 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  25.96 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.65 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  45.61 
 
 		 121 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  46.85 
 
 		 121 aa  99.4  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  27.92 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.1 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.65 
 
 		 213 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  25.23 
 
 		 334 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  25.08 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.42 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  26.23 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  26.46 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.91 
 
 		 331 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  24.77 
 
 		 334 aa  92.8  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.4 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.95 
 
 		 211 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 338 aa  92.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  26.4 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.64 
 
 		 203 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.46 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  23.89 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  27.62 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.04 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  25.54 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.1 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.84 
 
 		 219 aa  86.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.57 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  32.65 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 118 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  29.29 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.41 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.71 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  25.87 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.55 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  40.68 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 125 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.96 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.96 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  42.57 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  37.4 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  28.88 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 127 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.16 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3295  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.32 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.836784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3596  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.32 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.363783 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.8 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.42 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 		 935 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  38.66 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.89 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.75 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  36.07 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1417  two component Fis family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  36.29 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  39.6 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.43 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>