More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0902 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  242  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  64.46 
 
 		 331 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  65.29 
 
 		 335 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  61.98 
 
 		 331 aa  167  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 331 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 331 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 331 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 331 aa  166  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  63.64 
 
 		 331 aa  166  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 331 aa  166  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 331 aa  166  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 331 aa  166  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.64 
 
 		 331 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  61.16 
 
 		 331 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  61.16 
 
 		 331 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  61.16 
 
 		 331 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  60.33 
 
 		 331 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  62.81 
 
 		 376 aa  160  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 338 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  59.83 
 
 		 334 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  59.83 
 
 		 334 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  56.67 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  57.26 
 
 		 331 aa  141  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  55.83 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  55.83 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  55.83 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  55.83 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  55.83 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.99 
 
 		 330 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.24 
 
 		 333 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  53.33 
 
 		 342 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  53.45 
 
 		 334 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  52.43 
 
 		 339 aa  130  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  49.17 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  50 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  50 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  50 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  50 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 346 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  50 
 
 		 184 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  48.33 
 
 		 344 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  50 
 
 		 208 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  50 
 
 		 208 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  53.72 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  50.86 
 
 		 334 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  52.14 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  50.86 
 
 		 334 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  50.43 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  49.59 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  46.28 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  43.8 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  41.38 
 
 		 344 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  41.38 
 
 		 322 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  42.11 
 
 		 327 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  35.4 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.94 
 
 		 300 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.39 
 
 		 434 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.39 
 
 		 434 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0663  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527665  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 265 aa  66.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  26.27 
 
 		 732 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  33.61 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0196  response regulator receiver and unknown domain protein  39.53 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 917 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  29.06 
 
 		 641 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 631 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1303 aa  63.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.27 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3271  response regulator receiver domain-containing protein  35.45 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 876 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3857  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.54 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0057  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  34.17 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 1791 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1924  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 		 367 aa  62  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.620973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 348 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>