More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0601 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  100 
 
 		 121 aa  248  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  61.16 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  50.83 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  50.83 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  50.83 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  50.83 
 
 		 184 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  49.17 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  50.83 
 
 		 208 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  50.83 
 
 		 208 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  50.83 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  52.63 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  50.41 
 
 		 376 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  49.59 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.11 
 
 		 331 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  51.24 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  47.5 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  47.5 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  47.5 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 331 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  47.5 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  47.5 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 331 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 331 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 331 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  45.45 
 
 		 331 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.45 
 
 		 331 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.58 
 
 		 333 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  46.67 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  44.63 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  45 
 
 		 338 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.28 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.28 
 
 		 335 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  47.9 
 
 		 334 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.8 
 
 		 331 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  48.76 
 
 		 334 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.17 
 
 		 342 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.8 
 
 		 330 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  42.74 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  42.74 
 
 		 334 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  42.74 
 
 		 334 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 346 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  43.48 
 
 		 344 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  43.56 
 
 		 339 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  38.02 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  40 
 
 		 334 aa  90.1  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  41.74 
 
 		 331 aa  85.9  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  40.38 
 
 		 322 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  35.65 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  41.44 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  37.29 
 
 		 344 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 321 aa  80.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 119 aa  76.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  34.21 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2223  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.93 
 
 		 725 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.847933  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 498 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  33.61 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  35.51 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  35.51 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  35.51 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 265 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  35.51 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  35.51 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 969 aa  64.3  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2782  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 463 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 887 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  34.58 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  34.58 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>