More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0007 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 122 aa  245  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  95.9 
 
 		 122 aa  235  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  87.6 
 
 		 122 aa  218  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  86.07 
 
 		 122 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  86.07 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  86.07 
 
 		 208 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  86.07 
 
 		 122 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  86.07 
 
 		 122 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  86.07 
 
 		 208 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  85.95 
 
 		 122 aa  214  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  85.95 
 
 		 122 aa  214  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  85.95 
 
 		 122 aa  214  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  85.12 
 
 		 122 aa  213  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  85.12 
 
 		 122 aa  213  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  84.3 
 
 		 122 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  84.43 
 
 		 122 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 122 aa  209  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  84.62 
 
 		 117 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  58.68 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  58.68 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  58.68 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  58.68 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  60 
 
 		 331 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  58.68 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  58.68 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.17 
 
 		 331 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  53.28 
 
 		 335 aa  140  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  53.33 
 
 		 331 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  51.67 
 
 		 331 aa  137  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 331 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 331 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.85 
 
 		 330 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  49.17 
 
 		 331 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.17 
 
 		 331 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 338 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 331 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 331 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 331 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 331 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 331 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 331 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 331 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  49.17 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.89 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.62 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  49.17 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  50 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  47.93 
 
 		 376 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  50 
 
 		 334 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  50 
 
 		 334 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  50 
 
 		 331 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  49.04 
 
 		 339 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  44.44 
 
 		 334 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  44.44 
 
 		 334 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  43.1 
 
 		 117 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 346 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  41.67 
 
 		 344 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  42.24 
 
 		 334 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  42.86 
 
 		 344 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  42.24 
 
 		 327 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  42.37 
 
 		 322 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  41.67 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  42.86 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  37.74 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  34.21 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 250 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 1066 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 321 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 265 aa  67  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  28.81 
 
 		 1084 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1313 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 513 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.5 
 
 		 352 aa  63.5  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3195  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  28.95 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1803  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1016 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 1309 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 887 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  34.95 
 
 		 381 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 202 aa  60.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0080  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  60.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>