More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3836 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  100 
 
 		 338 aa  697    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  58.36 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  44.89 
 
 		 376 aa  337  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.45 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.55 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  47.75 
 
 		 331 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  47.45 
 
 		 331 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  47.75 
 
 		 331 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  47.75 
 
 		 331 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  47.75 
 
 		 331 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  47.15 
 
 		 331 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  47.15 
 
 		 331 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  47.15 
 
 		 331 aa  332  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  45.95 
 
 		 331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.35 
 
 		 331 aa  325  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.15 
 
 		 331 aa  325  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  45.35 
 
 		 331 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.15 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  45.65 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  44.78 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  45.07 
 
 		 334 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.11 
 
 		 333 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  42.47 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.27 
 
 		 342 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.64 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  39.94 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  39.88 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  40.65 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  41.25 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  33.53 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  33.53 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  32.44 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.29 
 
 		 203 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  53.33 
 
 		 121 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 122 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 122 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 122 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 122 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 122 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 122 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 122 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 122 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 122 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  47.11 
 
 		 122 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  47.11 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  47.93 
 
 		 122 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  47.11 
 
 		 208 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  47.11 
 
 		 122 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  47.11 
 
 		 122 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  47.11 
 
 		 122 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  47.11 
 
 		 208 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  48.28 
 
 		 117 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  44.63 
 
 		 122 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  44.63 
 
 		 122 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  44.63 
 
 		 122 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  44.63 
 
 		 122 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  43.8 
 
 		 122 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  43.8 
 
 		 122 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  45 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  45.83 
 
 		 121 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.55 
 
 		 207 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.72 
 
 		 207 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  39.52 
 
 		 132 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  41.03 
 
 		 117 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.18 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  40.83 
 
 		 121 aa  96.3  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  29.73 
 
 		 202 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  29.85 
 
 		 203 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  29.35 
 
 		 203 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  29.35 
 
 		 203 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  29.35 
 
 		 206 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.51 
 
 		 204 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  29.21 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 120 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  35.65 
 
 		 126 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  27.17 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.27 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 127 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.23 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  26.83 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  27.17 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  27.17 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  27.17 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  27.17 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  27.17 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  27.17 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  27.17 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 118 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1313 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.91 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>