98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5685 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
208 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
208 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
208 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  96.15 
 
 
211 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  93.75 
 
 
208 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  92.79 
 
 
211 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  89.22 
 
 
204 aa  363  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  65.38 
 
 
207 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  74.11 
 
 
207 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.94 
 
 
207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.46 
 
 
207 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  74.11 
 
 
207 aa  264  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  74.11 
 
 
207 aa  264  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  74.11 
 
 
207 aa  264  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  74.11 
 
 
207 aa  264  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  74.11 
 
 
207 aa  264  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  74.11 
 
 
207 aa  264  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  74.11 
 
 
207 aa  264  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  42.4 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  42.4 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  42.4 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  42.4 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  41.33 
 
 
182 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  30.2 
 
 
376 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  31.68 
 
 
194 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.29 
 
 
331 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
331 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.73 
 
 
203 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
331 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
331 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
331 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.63 
 
 
335 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.67 
 
 
331 aa  98.6  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.15 
 
 
331 aa  98.2  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  33.83 
 
 
331 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  33.83 
 
 
331 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  33.83 
 
 
331 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  33.66 
 
 
331 aa  97.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.04 
 
 
333 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  33.17 
 
 
331 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  34.38 
 
 
331 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.17 
 
 
331 aa  95.9  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  31.5 
 
 
334 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  33.17 
 
 
331 aa  94  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  29.95 
 
 
334 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  27.75 
 
 
338 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  28 
 
 
331 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  29.56 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.76 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  26.47 
 
 
202 aa  85.1  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  30.35 
 
 
334 aa  85.1  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  28.02 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  30.2 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  29.35 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  29.27 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  26.92 
 
 
344 aa  75.5  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.35 
 
 
342 aa  75.5  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.5 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  28.92 
 
 
190 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.38 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.89 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.42 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.53 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.7 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.88 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.95 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.6 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.52 
 
 
204 aa  55.1  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.39 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.1 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  26.7 
 
 
344 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.64 
 
 
204 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.64 
 
 
204 aa  52  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.95 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.26 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  28.57 
 
 
204 aa  51.6  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.88 
 
 
370 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.91 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.91 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.71 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.12 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.94 
 
 
346 aa  48.9  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  16.08 
 
 
198 aa  48.5  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  32.53 
 
 
417 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  34.78 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.14 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.42 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.68 
 
 
346 aa  45.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.62 
 
 
375 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.79 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  24.74 
 
 
322 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.58 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.76 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  21.32 
 
 
395 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.12 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  21.69 
 
 
321 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  41.86 
 
 
411 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>