85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0393 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  52.76 
 
 		 376 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  53.61 
 
 		 331 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  53.09 
 
 		 331 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  52.58 
 
 		 331 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  52.58 
 
 		 331 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  52.58 
 
 		 331 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  48.47 
 
 		 331 aa  211  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  52.58 
 
 		 331 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  52.06 
 
 		 331 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  52.58 
 
 		 331 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  52.06 
 
 		 331 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  52.06 
 
 		 331 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  52.06 
 
 		 331 aa  208  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.76 
 
 		 335 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  50.52 
 
 		 331 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  50 
 
 		 331 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.74 
 
 		 331 aa  198  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.94 
 
 		 331 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.6 
 
 		 342 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.27 
 
 		 333 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.31 
 
 		 330 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  43.16 
 
 		 346 aa  177  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  41.67 
 
 		 334 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  42.71 
 
 		 334 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  41.97 
 
 		 344 aa  165  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  41.15 
 
 		 334 aa  161  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  42.19 
 
 		 334 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 338 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  41.15 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  37.31 
 
 		 339 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.32 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.95 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.44 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  34 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  31.16 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  31.16 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  31.16 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  30.65 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  29.21 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.88 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  30.96 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  32.29 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  31.77 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  31.77 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  31.77 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  31.77 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  31.77 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  31.77 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  31.77 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  29.83 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.19 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.19 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.69 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.73 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.73 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.73 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.86 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  26.7 
 
 		 327 aa  85.1  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  27.8 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.77 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  24.16 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  22.73 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.96 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.86 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.87 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.95 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.77 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.54 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.25 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.66 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.74 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  22.68 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.17 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.87 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.08 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  19.9 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.33 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.18 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.35 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.7 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.7 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  22.6 
 
 		 395 aa  42  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.11 
 
 		 208 aa  42  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.24 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>