125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1888 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.7 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.54 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.86 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.87 
 
 		 213 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  36 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.32 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.5 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.25 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.12 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  28.5 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.13 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.13 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.65 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.64 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.43 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.87 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.24 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.4 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.5 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.39 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.59 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.47 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.15 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.2 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.5 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.59 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.97 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.26 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.26 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.53 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.73 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.48 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.48 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.03 
 
 		 333 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.12 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  27.78 
 
 		 339 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.08 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.47 
 
 		 546 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.94 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.71 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.28 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.59 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  24.52 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  24.52 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  24.52 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  29.08 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  30.43 
 
 		 334 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.78 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.92 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.47 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.47 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.59 
 
 		 331 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.87 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.86 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  24.39 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  24.24 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.34 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.56 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  24.74 
 
 		 331 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.74 
 
 		 418 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.37 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.73 
 
 		 331 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 		 422 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.74 
 
 		 331 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.79 
 
 		 333 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.47 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.76 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1723  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.78 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.348388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.49 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  26.43 
 
 		 334 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.34 
 
 		 357 aa  48.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 331 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 331 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.12 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  24.21 
 
 		 331 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  24.62 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.86 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  24.73 
 
 		 331 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.73 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  30 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  24.85 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.93 
 
 		 403 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.2 
 
 		 399 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.85 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.38 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  24.21 
 
 		 331 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  24.21 
 
 		 331 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.12 
 
 		 335 aa  44.7  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.32 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  24.52 
 
 		 1010 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.14 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.76 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  24.21 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.12 
 
 		 331 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  24.21 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.82 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  24.21 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>