107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A3166 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  99.03 
 
 
207 aa  403  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  75.49 
 
 
204 aa  300  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  74.52 
 
 
208 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  74.04 
 
 
208 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  74.04 
 
 
208 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  74.04 
 
 
208 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  74.04 
 
 
211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  67.15 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  66.67 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  72.6 
 
 
211 aa  278  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  66.18 
 
 
207 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  40.09 
 
 
203 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  40.09 
 
 
206 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  40.09 
 
 
203 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  41.04 
 
 
203 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  32.84 
 
 
376 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.34 
 
 
203 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.9 
 
 
331 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
331 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  33.83 
 
 
331 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.01 
 
 
333 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  33.83 
 
 
331 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  33.83 
 
 
331 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  34.87 
 
 
331 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  33.83 
 
 
331 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  32.84 
 
 
331 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  32.84 
 
 
331 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  32.84 
 
 
331 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  32.84 
 
 
331 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.51 
 
 
335 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  33.85 
 
 
331 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  31.82 
 
 
334 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
331 aa  99  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
331 aa  99  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  38.22 
 
 
182 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  28.57 
 
 
331 aa  98.2  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.84 
 
 
331 aa  95.9  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  30.24 
 
 
194 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  31.82 
 
 
334 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  29.7 
 
 
338 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  30.05 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  30 
 
 
334 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  28.44 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  30.58 
 
 
346 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.78 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  30.46 
 
 
334 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  29.51 
 
 
339 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  27.92 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.55 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.87 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  27.04 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  31.53 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.78 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.21 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.06 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.03 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.93 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.72 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  26 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.86 
 
 
370 aa  60.1  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  26 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.88 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.77 
 
 
202 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.59 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.14 
 
 
346 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.2 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  27.14 
 
 
346 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.06 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.15 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  23.97 
 
 
321 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.48 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  29.85 
 
 
344 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.61 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.35 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.36 
 
 
220 aa  52  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
207 aa  52  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  25.85 
 
 
417 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  24.48 
 
 
406 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  25 
 
 
393 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.94 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  16.67 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.39 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  26.39 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.64 
 
 
199 aa  48.5  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  26.06 
 
 
401 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  27.61 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.49 
 
 
205 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  28.57 
 
 
360 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  25.48 
 
 
422 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  50 
 
 
375 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  24.48 
 
 
411 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.62 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.66 
 
 
369 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>