123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7025 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  96.14 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  86.47 
 
 		 207 aa  363  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  65.69 
 
 		 204 aa  267  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.94 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  65.82 
 
 		 207 aa  251  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.94 
 
 		 211 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.46 
 
 		 208 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.46 
 
 		 208 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.46 
 
 		 208 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.94 
 
 		 211 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  65.82 
 
 		 207 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  65.82 
 
 		 207 aa  244  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  65.82 
 
 		 207 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  65.82 
 
 		 207 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  65.82 
 
 		 207 aa  244  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  65.82 
 
 		 207 aa  244  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  65.82 
 
 		 207 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  40.57 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  40.57 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  40.57 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  40.09 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  38.12 
 
 		 331 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  35.82 
 
 		 376 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.95 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.63 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 331 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 331 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 331 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 331 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.27 
 
 		 331 aa  118  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  35.78 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 331 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.98 
 
 		 335 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  33.01 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 331 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 331 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 331 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 331 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.15 
 
 		 331 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.78 
 
 		 331 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  39.79 
 
 		 182 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  32.02 
 
 		 331 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  31.55 
 
 		 338 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.67 
 
 		 333 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  34.16 
 
 		 334 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  33.16 
 
 		 334 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  32.21 
 
 		 334 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  31.4 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  33.17 
 
 		 334 aa  98.2  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  32.67 
 
 		 334 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  32.62 
 
 		 339 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  32.65 
 
 		 344 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  30.05 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.61 
 
 		 330 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.79 
 
 		 342 aa  89.4  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.32 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  29.7 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.14 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.22 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.76 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.62 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.8 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.81 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.88 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.02 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.16 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  25.86 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.14 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.38 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  26.8 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.86 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.4 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.24 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  18.59 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.62 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.89 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.89 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.8 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.64 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  22.89 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.91 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.53 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  22 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.15 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.28 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.15 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.9 
 
 		 375 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.86 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.67 
 
 		 417 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  31.08 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.13 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.69 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>