More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2380 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  100 
 
 
411 aa  818    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  51.12 
 
 
572 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  47.42 
 
 
360 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  42.42 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.99 
 
 
422 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  41.18 
 
 
395 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  41.53 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  39.29 
 
 
378 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  38.16 
 
 
402 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  40.48 
 
 
375 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.76 
 
 
398 aa  256  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  37.39 
 
 
417 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.84 
 
 
369 aa  247  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  40.11 
 
 
381 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  35.94 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.97 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.32 
 
 
346 aa  229  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  37.23 
 
 
346 aa  229  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.15 
 
 
357 aa  208  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.82 
 
 
370 aa  205  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  33.58 
 
 
372 aa  202  7e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.23 
 
 
331 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.87 
 
 
333 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  39.5 
 
 
406 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  34.38 
 
 
554 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  33.06 
 
 
548 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  33.92 
 
 
546 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  34.51 
 
 
546 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  34.51 
 
 
546 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  34.51 
 
 
546 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  34.51 
 
 
546 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  33.92 
 
 
545 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  34.22 
 
 
546 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  33.04 
 
 
546 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  33.04 
 
 
546 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  28.94 
 
 
375 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  55.88 
 
 
150 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  55.88 
 
 
150 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  52.46 
 
 
153 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  44.64 
 
 
175 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  57.89 
 
 
156 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  61.8 
 
 
154 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  48.41 
 
 
203 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  60.44 
 
 
165 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  60.44 
 
 
165 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  60.44 
 
 
143 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  60.92 
 
 
142 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  60.44 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  64.71 
 
 
97 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  51.18 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  60.44 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  60.44 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  59.34 
 
 
143 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  63.53 
 
 
97 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  63.53 
 
 
97 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  62.07 
 
 
142 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  60.92 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  50 
 
 
157 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  61.9 
 
 
147 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  59.3 
 
 
149 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  59.3 
 
 
149 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  61.18 
 
 
142 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  57.14 
 
 
163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  47.79 
 
 
137 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  45.11 
 
 
139 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  62.79 
 
 
155 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 
163 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  60.92 
 
 
156 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  57.14 
 
 
162 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  60.47 
 
 
226 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 
162 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 
162 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 
148 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 
143 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  59.34 
 
 
136 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  58.24 
 
 
159 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  58.62 
 
 
154 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  47.73 
 
 
137 aa  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  59.34 
 
 
137 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  61.63 
 
 
138 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  61.63 
 
 
138 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  61.18 
 
 
132 aa  113  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  57.47 
 
 
154 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  58.51 
 
 
152 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  61.45 
 
 
155 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  61.36 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  60 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 
163 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  57.61 
 
 
174 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  61.36 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  53.4 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  60.47 
 
 
190 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  58.14 
 
 
138 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  57.47 
 
 
154 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  45.86 
 
 
136 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  61.36 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  61.18 
 
 
188 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  60.47 
 
 
170 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>