More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1024 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
153 aa  308  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  80.71 
 
 
142 aa  192  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  65.33 
 
 
148 aa  176  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  68.18 
 
 
143 aa  174  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  63.7 
 
 
139 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  69.4 
 
 
149 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  69.4 
 
 
149 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  63.64 
 
 
142 aa  166  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  64.03 
 
 
143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  63.31 
 
 
143 aa  164  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  65.15 
 
 
124 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  64.03 
 
 
165 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  64.03 
 
 
165 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  64.03 
 
 
162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  64.03 
 
 
162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  64.03 
 
 
162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  87.5 
 
 
156 aa  163  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  63.46 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  63.31 
 
 
163 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  88.37 
 
 
150 aa  160  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  62.59 
 
 
162 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  88.37 
 
 
150 aa  160  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  62.59 
 
 
162 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  62.59 
 
 
162 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  65.91 
 
 
142 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  62.12 
 
 
147 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  68.42 
 
 
151 aa  157  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  87.21 
 
 
156 aa  157  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  62.88 
 
 
163 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  64.39 
 
 
161 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  62.41 
 
 
154 aa  154  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  59.56 
 
 
137 aa  154  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  59.56 
 
 
137 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  59.56 
 
 
137 aa  154  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  59.56 
 
 
137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  75.25 
 
 
132 aa  153  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  58.82 
 
 
137 aa  153  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  58.82 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  83.72 
 
 
154 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  58.82 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  83.72 
 
 
154 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  74.26 
 
 
159 aa  150  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  59.54 
 
 
137 aa  150  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  54.23 
 
 
136 aa  150  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  69.64 
 
 
155 aa  150  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  58.78 
 
 
137 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  58.78 
 
 
137 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  53.85 
 
 
138 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  58.78 
 
 
137 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  54.36 
 
 
175 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  58.78 
 
 
137 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  58.78 
 
 
137 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  57.89 
 
 
138 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  57.89 
 
 
138 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  54.55 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  56.33 
 
 
155 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  50.31 
 
 
155 aa  144  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  76.74 
 
 
137 aa  144  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  76.74 
 
 
137 aa  144  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 
203 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  53.33 
 
 
152 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  53.33 
 
 
152 aa  140  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  54.29 
 
 
153 aa  140  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  50.93 
 
 
161 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  52.05 
 
 
152 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  53.02 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  53.02 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  52.63 
 
 
154 aa  133  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  46.75 
 
 
166 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
139 aa  133  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  53.69 
 
 
154 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  52.17 
 
 
136 aa  130  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  52.17 
 
 
136 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  65.05 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  65.05 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  46.5 
 
 
226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  70.65 
 
 
143 aa  128  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  47.48 
 
 
138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  50 
 
 
135 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  43.79 
 
 
153 aa  127  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  48.95 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  60.58 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  49.33 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  49.33 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  47.18 
 
 
190 aa  124  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  59.43 
 
 
174 aa  124  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  48.85 
 
 
126 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  49.62 
 
 
126 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  49.62 
 
 
127 aa  123  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  49.62 
 
 
126 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  49.62 
 
 
126 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  49.62 
 
 
126 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  48.25 
 
 
131 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  67.05 
 
 
109 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  48.85 
 
 
124 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  48.85 
 
 
124 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  48.85 
 
 
124 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 
170 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  65.17 
 
 
155 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>