More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1329 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 154 aa  309  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  59.77 
 
 		 203 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  65.52 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  60.39 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  59.63 
 
 		 226 aa  174  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  61.69 
 
 		 135 aa  173  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  59.35 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  59.35 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  63.57 
 
 		 127 aa  168  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  64.03 
 
 		 124 aa  167  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  62.86 
 
 		 127 aa  167  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  59.87 
 
 		 157 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  59.87 
 
 		 157 aa  166  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  64.03 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  64.03 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  64.03 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  64.03 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  62.86 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  59.18 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  63.31 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  63.31 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  63.83 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  62.59 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  58.13 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  62.59 
 
 		 131 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  61.43 
 
 		 127 aa  163  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  62.41 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  52.66 
 
 		 166 aa  161  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  56.25 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  54.12 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  53.89 
 
 		 174 aa  160  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  54.49 
 
 		 154 aa  159  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  72.82 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  72.82 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  58.62 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  56.69 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  57.72 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  57.72 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  57.43 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  75.51 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  52.2 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  67.96 
 
 		 111 aa  151  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  79.57 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  55.86 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  56.55 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  52.86 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  76.29 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  52.67 
 
 		 138 aa  147  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  56.55 
 
 		 162 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  56.55 
 
 		 165 aa  146  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  56.55 
 
 		 165 aa  146  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  56.55 
 
 		 162 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  56.55 
 
 		 162 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  56.83 
 
 		 124 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  59.12 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  53.9 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  53.79 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  53.79 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  53.79 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  52.45 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  53.1 
 
 		 163 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  55.4 
 
 		 163 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  53.47 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  49.04 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  49.67 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  52.94 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  50.68 
 
 		 188 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  50.35 
 
 		 190 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  54.35 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  53.1 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  47.71 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  72.29 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  52.55 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  72.29 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  49.32 
 
 		 175 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  63.37 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  47.06 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  63.37 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  51.02 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  62.38 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  47.06 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  45.75 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  54.62 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  50.33 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  64.89 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  61.39 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  53.28 
 
 		 175 aa  130  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  46.3 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  50.33 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 137 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 137 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 137 aa  130  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  58.04 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 137 aa  130  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 137 aa  130  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  46.1 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  48.08 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  49.67 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>