295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0375 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
190 aa  377  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  62.11 
 
 
170 aa  201  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  72.22 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  87.85 
 
 
175 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  67.13 
 
 
188 aa  187  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  54.26 
 
 
154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  64.29 
 
 
99 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  70.59 
 
 
99 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  51.13 
 
 
135 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  46.81 
 
 
142 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  68.24 
 
 
101 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  49.25 
 
 
143 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  69.05 
 
 
103 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  48.61 
 
 
161 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  44.44 
 
 
135 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  61.7 
 
 
97 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  48.51 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  48.87 
 
 
124 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  49.25 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  48.51 
 
 
143 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  48.51 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  67.86 
 
 
101 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  61.7 
 
 
97 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  61.7 
 
 
97 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  48.51 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  49.25 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  49.25 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  48.51 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  48.51 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  67.86 
 
 
101 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  48.59 
 
 
152 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  48.59 
 
 
152 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  67.86 
 
 
101 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  49.25 
 
 
131 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  48.51 
 
 
163 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  41.86 
 
 
175 aa  124  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  47.92 
 
 
152 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  49.31 
 
 
154 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  50.38 
 
 
139 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  48.87 
 
 
163 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  46.79 
 
 
154 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  48.51 
 
 
161 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  44.37 
 
 
154 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  41.18 
 
 
203 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  57.84 
 
 
132 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50 
 
 
143 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  61.63 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  52.29 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  67.07 
 
 
174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  49.66 
 
 
154 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  58.24 
 
 
147 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  58.7 
 
 
103 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  42.96 
 
 
139 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  45.57 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  61.63 
 
 
150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  48.82 
 
 
159 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  61.63 
 
 
150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  44.03 
 
 
154 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  65.85 
 
 
157 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  65.85 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  65.85 
 
 
157 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  44.29 
 
 
136 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  59.3 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  56.82 
 
 
151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 
136 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  44.37 
 
 
153 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  60.71 
 
 
155 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  52.59 
 
 
124 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  52.59 
 
 
124 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  52.59 
 
 
124 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  61.18 
 
 
131 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  46.62 
 
 
124 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  55.45 
 
 
155 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  49.62 
 
 
127 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  57.65 
 
 
155 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  39.74 
 
 
163 aa  114  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  62.65 
 
 
126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  62.65 
 
 
126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  62.65 
 
 
126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  62.65 
 
 
126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  60.24 
 
 
142 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  53.85 
 
 
153 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  45 
 
 
138 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  58.62 
 
 
142 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  61.18 
 
 
127 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  45.86 
 
 
127 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  57.14 
 
 
398 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  61.45 
 
 
112 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  61.45 
 
 
127 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  61.45 
 
 
112 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  60.47 
 
 
411 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  61.45 
 
 
127 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  62.65 
 
 
124 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  51.85 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  57.65 
 
 
138 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0582  flagellar motor switch protein FliN  66.23 
 
 
109 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  60.76 
 
 
357 aa  112  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  58.62 
 
 
156 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  61.45 
 
 
126 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>