More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0862 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
398 aa  787    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  49.65 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  46.27 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  46.86 
 
 
401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  46.32 
 
 
393 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44.24 
 
 
417 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  45.17 
 
 
402 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  46.29 
 
 
375 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  44.07 
 
 
406 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  41.4 
 
 
401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.05 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  41.65 
 
 
360 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  41.35 
 
 
381 aa  256  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  38.93 
 
 
411 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.05 
 
 
357 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  40.56 
 
 
572 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.78 
 
 
370 aa  238  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  36.74 
 
 
372 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  47.14 
 
 
395 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.78 
 
 
369 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  30.77 
 
 
548 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  30.64 
 
 
554 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  31.43 
 
 
546 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  32 
 
 
545 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.11 
 
 
331 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.77 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  41.77 
 
 
346 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  41.38 
 
 
546 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  41.38 
 
 
546 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  41.92 
 
 
546 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  41.92 
 
 
546 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  41.92 
 
 
546 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.93 
 
 
346 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  29.48 
 
 
393 aa  142  7e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  40.62 
 
 
546 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  40.62 
 
 
546 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  60.82 
 
 
175 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  53.92 
 
 
375 aa  125  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  57.28 
 
 
359 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 
226 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  56.7 
 
 
155 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  54.55 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  46.72 
 
 
138 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  46.72 
 
 
138 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  44.35 
 
 
137 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
170 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  49.53 
 
 
180 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  43.55 
 
 
137 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 
190 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  49.53 
 
 
175 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  52.58 
 
 
136 aa  112  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  52.58 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  52.58 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 
188 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  52.58 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  52.58 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  52.58 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  56.98 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  52.58 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  51.55 
 
 
137 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 
137 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 
137 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 
137 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 
137 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 
137 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 
137 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  47.66 
 
 
154 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  52.94 
 
 
135 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  42.28 
 
 
142 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  48.48 
 
 
174 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  57.14 
 
 
154 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  45.22 
 
 
166 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  57.14 
 
 
161 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  54.26 
 
 
154 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  51.02 
 
 
155 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  50.52 
 
 
165 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  50.52 
 
 
143 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  54.02 
 
 
97 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  58.33 
 
 
155 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  57.14 
 
 
154 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  50.52 
 
 
165 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
152 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  50.52 
 
 
124 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  50 
 
 
152 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  50.52 
 
 
162 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  57.14 
 
 
157 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  50.52 
 
 
162 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  57.14 
 
 
157 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  50.52 
 
 
162 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  52.87 
 
 
97 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  43.86 
 
 
203 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  37.24 
 
 
153 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  49.48 
 
 
151 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  49.48 
 
 
143 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  52.87 
 
 
97 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  57.14 
 
 
152 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  52 
 
 
156 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 
163 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 
161 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>