More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2174 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  100 
 
 
135 aa  270  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  58.49 
 
 
226 aa  174  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  64.33 
 
 
152 aa  173  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  63.82 
 
 
152 aa  170  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  63.82 
 
 
152 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  61.39 
 
 
154 aa  169  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  61.01 
 
 
161 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  61.39 
 
 
154 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  63.06 
 
 
154 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  68.75 
 
 
124 aa  167  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  68.75 
 
 
124 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  68.75 
 
 
124 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  68.29 
 
 
127 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  68.8 
 
 
126 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  67.46 
 
 
124 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  68.8 
 
 
126 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  68.55 
 
 
126 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  68.8 
 
 
126 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  68.8 
 
 
126 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  63.77 
 
 
139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  61.78 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  52.27 
 
 
174 aa  163  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  61.78 
 
 
157 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  68.55 
 
 
131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  68.25 
 
 
127 aa  163  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  66.67 
 
 
127 aa  163  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  67.48 
 
 
127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  65.47 
 
 
136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  88.3 
 
 
155 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  64.03 
 
 
136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  56.6 
 
 
166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  66.67 
 
 
127 aa  160  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  61.07 
 
 
154 aa  158  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  68.22 
 
 
135 aa  157  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  53.01 
 
 
203 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  63.41 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  57.78 
 
 
153 aa  153  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  66.67 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  62.04 
 
 
138 aa  150  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  61.83 
 
 
143 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  65.35 
 
 
127 aa  148  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  61.24 
 
 
143 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  59.06 
 
 
143 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  61.24 
 
 
162 aa  147  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  61.24 
 
 
162 aa  147  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  61.24 
 
 
162 aa  147  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  61.16 
 
 
154 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  61.24 
 
 
165 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  61.24 
 
 
165 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  56.69 
 
 
163 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  57.6 
 
 
153 aa  147  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 
161 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  61.79 
 
 
124 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  58.68 
 
 
163 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  56.69 
 
 
162 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  56.69 
 
 
162 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  56.69 
 
 
162 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  56.55 
 
 
175 aa  147  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  72.82 
 
 
129 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  60.83 
 
 
154 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  54.48 
 
 
147 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  69.07 
 
 
154 aa  139  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  57.66 
 
 
111 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  78.57 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  78.57 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  51.35 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  54.89 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  51.35 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  67.37 
 
 
109 aa  137  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  51.35 
 
 
148 aa  137  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  68.04 
 
 
159 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  53.19 
 
 
142 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  73.81 
 
 
111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  65 
 
 
155 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  67.33 
 
 
150 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  67.33 
 
 
150 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  71.43 
 
 
156 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  46.62 
 
 
188 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  61.11 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  53.12 
 
 
137 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  63.27 
 
 
132 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  50.39 
 
 
136 aa  130  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  54.29 
 
 
142 aa  130  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  52.34 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  49.64 
 
 
139 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  63.27 
 
 
155 aa  130  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  65.98 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  46.58 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  50.4 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  50.79 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  48.92 
 
 
180 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  43.71 
 
 
170 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  48.92 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  48.92 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  48.92 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  48.92 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>