More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2038 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  100 
 
 		 402 aa  809    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  60.33 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  54.05 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  49.4 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  47.79 
 
 		 401 aa  350  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  47.47 
 
 		 401 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  46.97 
 
 		 393 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  47.73 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.87 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.71 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  42.12 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.26 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  37.7 
 
 		 411 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  40.79 
 
 		 572 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.05 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.14 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 		 395 aa  190  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.57 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  40.42 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  40.36 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.12 
 
 		 333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.46 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.84 
 
 		 331 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.17 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  29.85 
 
 		 393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  28.29 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  40.1 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  40.1 
 
 		 546 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  39.58 
 
 		 546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  39.58 
 
 		 546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  39.58 
 
 		 546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  39.58 
 
 		 546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  39.58 
 
 		 546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  38.07 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  39.49 
 
 		 548 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  38.97 
 
 		 546 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  38.97 
 
 		 546 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  60.4 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  57.45 
 
 		 175 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  61.45 
 
 		 99 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  58.43 
 
 		 150 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  58.43 
 
 		 150 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  55.32 
 
 		 151 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  54.29 
 
 		 153 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  46.03 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  59.04 
 
 		 99 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  47.93 
 
 		 137 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  47.93 
 
 		 137 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  53.54 
 
 		 142 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  59.76 
 
 		 156 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  53.19 
 
 		 154 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  47.93 
 
 		 137 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  47.93 
 
 		 137 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  47.93 
 
 		 137 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  47.93 
 
 		 137 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  55.42 
 
 		 101 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  49.54 
 
 		 155 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  52.13 
 
 		 154 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  47.11 
 
 		 137 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  70.67 
 
 		 113 aa  108  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  48.15 
 
 		 159 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  41.98 
 
 		 138 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  51.09 
 
 		 101 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  51.09 
 
 		 101 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  56.63 
 
 		 103 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  46.3 
 
 		 161 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  41.98 
 
 		 138 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  46.3 
 
 		 163 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  52.34 
 
 		 137 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  52.34 
 
 		 137 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 143 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  55.56 
 
 		 101 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 162 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  58.02 
 
 		 97 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  52.34 
 
 		 137 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 154 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  57.32 
 
 		 190 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  52.34 
 
 		 137 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  52.34 
 
 		 137 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  58.54 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 162 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 162 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 165 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 165 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 124 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  56.79 
 
 		 97 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  56.79 
 
 		 97 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  57.32 
 
 		 170 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  52.34 
 
 		 137 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  46.3 
 
 		 163 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  58.54 
 
 		 175 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 143 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  46.3 
 
 		 162 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  46.3 
 
 		 162 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  46.3 
 
 		 162 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 		 137 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  58.54 
 
 		 156 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  56.1 
 
 		 180 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  58.54 
 
 		 142 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  56.96 
 
 		 147 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>