More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0040 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 163 aa  322  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  94.48 
 
 		 161 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  95.09 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  91.41 
 
 		 162 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  91.41 
 
 		 162 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  91.41 
 
 		 162 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  78.18 
 
 		 165 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  78.18 
 
 		 165 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  89.92 
 
 		 143 aa  243  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  88.37 
 
 		 143 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  87.73 
 
 		 159 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  88.37 
 
 		 162 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  88.37 
 
 		 162 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  88.37 
 
 		 162 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  91.13 
 
 		 124 aa  237  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  71.17 
 
 		 154 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  85.12 
 
 		 154 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  86.32 
 
 		 154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  72.26 
 
 		 142 aa  187  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  73.08 
 
 		 142 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  63.89 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  81.19 
 
 		 132 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  74.07 
 
 		 151 aa  168  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  77.14 
 
 		 156 aa  166  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  54.09 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  58.5 
 
 		 147 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  56.34 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  78.22 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  78.22 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  58.78 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  54.05 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  62.99 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  54.96 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  57.58 
 
 		 137 aa  154  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  57.58 
 
 		 137 aa  154  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 		 137 aa  154  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 		 137 aa  154  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  57.58 
 
 		 137 aa  154  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 		 137 aa  154  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  86.9 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  55.94 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  59.09 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  57.25 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  62.4 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  56.49 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  74.74 
 
 		 153 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  56.82 
 
 		 138 aa  151  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  56.82 
 
 		 138 aa  151  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  58.46 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  58.46 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  58.46 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  58.46 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  58.46 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  71.72 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  61.11 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  58.65 
 
 		 139 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  59.06 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  59.06 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  58.59 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  53.9 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  58.68 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  62.4 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  63.41 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  55.04 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  62.6 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  62.6 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  62.6 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  60.98 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  60.98 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  60.98 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  60.98 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  60.16 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  57.6 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  50.36 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  58.87 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  59.06 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  53.85 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  58.87 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  56.82 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  51.7 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  53.15 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  51.02 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  63.92 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  51.37 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  47.8 
 
 		 203 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  53.79 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  72.29 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  53.73 
 
 		 138 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  53.03 
 
 		 136 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  49.02 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  63.83 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 226 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  54.76 
 
 		 157 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  49.39 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  53.97 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  59.5 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  69.41 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  71.08 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  67.82 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>