142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0023 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
204 aa  400  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
204 aa  400  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  50 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.51 
 
 
204 aa  185  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.09 
 
 
210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.27 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.05 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.5 
 
 
210 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  31 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.83 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.16 
 
 
205 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.24 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.98 
 
 
207 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.3 
 
 
208 aa  111  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.04 
 
 
212 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.5 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.84 
 
 
205 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.16 
 
 
198 aa  104  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.54 
 
 
205 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.83 
 
 
201 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.23 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.34 
 
 
206 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.71 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.37 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.35 
 
 
198 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.34 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  31.34 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  30.73 
 
 
1010 aa  85.1  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.03 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.35 
 
 
546 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.16 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  32.02 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.26 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.79 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  32.19 
 
 
395 aa  71.2  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  36.05 
 
 
378 aa  68.9  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.92 
 
 
357 aa  68.2  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.71 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.47 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.18 
 
 
381 aa  65.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.29 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  32.21 
 
 
372 aa  65.1  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  31.91 
 
 
360 aa  64.7  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.29 
 
 
417 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  32.62 
 
 
393 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  31.39 
 
 
401 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.65 
 
 
369 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.94 
 
 
346 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.41 
 
 
398 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.64 
 
 
346 aa  62  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  31.91 
 
 
402 aa  62  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.97 
 
 
213 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.38 
 
 
422 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  30 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.43 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
207 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.72 
 
 
331 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.22 
 
 
401 aa  58.2  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.48 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.29 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  30.67 
 
 
546 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.92 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.06 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  28.17 
 
 
546 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  28.17 
 
 
545 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  30.67 
 
 
546 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  30.67 
 
 
546 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  30.67 
 
 
546 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
418 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.35 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  30.43 
 
 
554 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.14 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.4 
 
 
403 aa  55.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  26.97 
 
 
406 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  28.57 
 
 
546 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.8 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  31.69 
 
 
548 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  31.69 
 
 
546 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  31.69 
 
 
546 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1723  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.32 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.348388  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0957  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.82 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  27.39 
 
 
375 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.75 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.16 
 
 
375 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.04 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.57 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.46 
 
 
406 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3148  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.09 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.04 
 
 
399 aa  52  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.65 
 
 
204 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.1 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.56 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0179  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  23.94 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.68 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.73 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  23.94 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  23.94 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>