More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03100 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03100  response regulator  100 
 
 		 331 aa  675    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  53.49 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  50.76 
 
 		 331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  51.38 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.27 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.15 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  50.76 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 331 aa  348  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 331 aa  348  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 331 aa  348  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 331 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.76 
 
 		 331 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  50.15 
 
 		 331 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  50.15 
 
 		 331 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  50.15 
 
 		 331 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.94 
 
 		 331 aa  344  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 331 aa  342  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 331 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.76 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.6 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  46.99 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  47.15 
 
 		 334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  42.47 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  46.25 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  44.24 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  45.18 
 
 		 346 aa  309  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  46.25 
 
 		 334 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  45.48 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.49 
 
 		 342 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  43.25 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.47 
 
 		 203 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  31.4 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  32.72 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  31.08 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  57.26 
 
 		 121 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 122 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 122 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 122 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 122 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 122 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 122 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  51.35 
 
 		 121 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  46.61 
 
 		 122 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 122 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 122 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 122 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  45.76 
 
 		 122 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  45.76 
 
 		 122 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  45.76 
 
 		 122 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  46.96 
 
 		 117 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  45.76 
 
 		 208 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  48.28 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  45.76 
 
 		 184 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  45.76 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  48.28 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  47.41 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  48.28 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  48.28 
 
 		 122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  48.28 
 
 		 122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.02 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  46.15 
 
 		 117 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  34.33 
 
 		 202 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.03 
 
 		 207 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  47.79 
 
 		 121 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  43.7 
 
 		 132 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  27.62 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  30 
 
 		 207 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  41.74 
 
 		 121 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  28.72 
 
 		 207 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  25.89 
 
 		 194 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.41 
 
 		 204 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  28.34 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  28.34 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  28.34 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  28.34 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  28.34 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  28.34 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  28.34 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  28 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  28 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  28 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.5 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  26.04 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  28 
 
 		 211 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.5 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  25.52 
 
 		 203 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  25.52 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  25.52 
 
 		 203 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.83 
 
 		 772 aa  70.1  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  35.96 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 265 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  32.31 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 118 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  27.97 
 
 		 732 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>