More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2606 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
342 aa  690    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  51.17 
 
 
331 aa  348  8e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.88 
 
 
331 aa  346  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  49.57 
 
 
331 aa  342  5e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  49.86 
 
 
331 aa  342  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.71 
 
 
331 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  49.57 
 
 
331 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  49.12 
 
 
331 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  49.12 
 
 
331 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  48.84 
 
 
331 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  48.84 
 
 
331 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  48.84 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  48.84 
 
 
331 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.12 
 
 
335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  48.83 
 
 
331 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.71 
 
 
331 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  44.3 
 
 
376 aa  330  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  48.54 
 
 
331 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.35 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.86 
 
 
333 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  44.15 
 
 
346 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  42.27 
 
 
338 aa  285  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  42.44 
 
 
344 aa  278  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  43.49 
 
 
331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  41.47 
 
 
334 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  40.59 
 
 
334 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  39.71 
 
 
334 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  40.12 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  40.91 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  40.12 
 
 
334 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  34.55 
 
 
322 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.6 
 
 
203 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  34.01 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  33.94 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  53.72 
 
 
122 aa  135  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  53.72 
 
 
122 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
122 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
122 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  52.89 
 
 
122 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  53.72 
 
 
122 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  53.72 
 
 
122 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  53.72 
 
 
122 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  53.33 
 
 
121 aa  132  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
122 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  52.89 
 
 
122 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  52.07 
 
 
122 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  52.07 
 
 
122 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  52.07 
 
 
122 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  52.07 
 
 
122 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  52.07 
 
 
184 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  52.07 
 
 
208 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  52.07 
 
 
208 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  52.59 
 
 
117 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  48.76 
 
 
122 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  48.76 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  48.76 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  48.76 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  48.76 
 
 
122 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  48.76 
 
 
122 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  45.69 
 
 
117 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  44.17 
 
 
121 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  46.34 
 
 
132 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  42.5 
 
 
121 aa  92.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  34.24 
 
 
202 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.79 
 
 
207 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  32.81 
 
 
203 aa  89.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.79 
 
 
207 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  32.29 
 
 
203 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  32.29 
 
 
206 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  32.29 
 
 
203 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
127 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  26.1 
 
 
321 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  39.17 
 
 
121 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.93 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.7 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  36.54 
 
 
126 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.41 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 
120 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  30.22 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.25 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  36.19 
 
 
123 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  33.63 
 
 
125 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  33.63 
 
 
125 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  33.62 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.41 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  29.51 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  37.25 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  33.88 
 
 
131 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  33.62 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.81 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0999  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.42 
 
 
872 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.84 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.32 
 
 
208 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  38.1 
 
 
1015 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0748  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.9 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  37.96 
 
 
236 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0763  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.9 
 
 
355 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.43 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>