More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0993 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  88.19 
 
 		 127 aa  230  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3669  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4041  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3092  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5022  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2017  response regulator CheY  37.72 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3065  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735156  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  36.44 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1111  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0272953  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1055 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.18 
 
 		 226 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  38.18 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  33.91 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.18 
 
 		 226 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2618  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.83 
 
 		 453 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0380  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 522 aa  70.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0965  two-component response regulator PilR  40 
 
 		 446 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.25964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 244 aa  70.5  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3100  response regulator  37.61 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1841  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.91 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1660  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.27 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2553  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1194499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2693  response regulator  35.51 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0520  two component response regulator  38.94 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1967  response regulator receiver protein  36.78 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 483 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  38.18 
 
 		 1040 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2709  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  38.74 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5187  two-component response regulator PilR  40 
 
 		 445 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  37.27 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60260  two-component response regulator PilR  40 
 
 		 445 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000831057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2092  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 298 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4840  two-component response regulator PilR  40 
 
 		 448 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2355  two component Fis family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 465 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.93 
 
 		 457 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 457 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0722  helix-turn-helix, Fis-type  37.29 
 
 		 445 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0504  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 443 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  35.96 
 
 		 1122 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  35 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0823  type 4 fimbriae expression regulatory protein pilR  37.29 
 
 		 446 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  36.36 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2555  two-component response regulator PilR  36.44 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822177  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0133  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.651583  hitchhiker  0.000285667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29000  sigma54-dependent response regulator, two-component  39.47 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.99042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2709  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 501 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1263  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 877 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3203  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.14663  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4153  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.96 
 
 		 466 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0202  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04881  two-component system regulatory protein  36.21 
 
 		 466 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.476586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 483 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0537  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 446 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.27 
 
 		 391 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  40.54 
 
 		 971 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 443 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2145  two component signal transduction response regulator  35.58 
 
 		 492 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 375 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2764  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 466 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0874  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 464 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.17 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6827  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 389 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  36.75 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 1425 aa  63.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0318  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.52 
 
 		 444 aa  63.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.623728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1973  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00115006  hitchhiker  0.0000141072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 391 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1503  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 513 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2284  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 379 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0866  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 496 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555974  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3323  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.45 
 
 		 458 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581416  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>