More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0922 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  100 
 
 		 327 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  44.98 
 
 		 344 aa  285  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  44.71 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.09 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  39.09 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.34 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 331 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 331 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 331 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  38.74 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  35.52 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  38.44 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  38.44 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  38.44 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  38.44 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.64 
 
 		 331 aa  202  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.97 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  35.03 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 331 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  35.03 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  36.56 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.78 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  33.07 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  32.44 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.93 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  30.75 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.3 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  34.6 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  30.75 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.63 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  31.4 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  27.88 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  41.09 
 
 		 132 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 122 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  42.11 
 
 		 121 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 122 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  96.3  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 122 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  95.9  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  40.52 
 
 		 122 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  40.52 
 
 		 122 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  40.52 
 
 		 122 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  40.52 
 
 		 184 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  40.71 
 
 		 117 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.7 
 
 		 203 aa  93.2  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  40.52 
 
 		 208 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  40.52 
 
 		 208 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  40.52 
 
 		 122 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 122 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 122 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  40 
 
 		 118 aa  89.7  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 		 120 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  40 
 
 		 119 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  23.64 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  38.94 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  35.65 
 
 		 121 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  40 
 
 		 117 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  33.91 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  37.17 
 
 		 126 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 123 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  30.77 
 
 		 641 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  34.78 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1954 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  36.11 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 122 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0931  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 125 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2284  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1258 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 935 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  32.11 
 
 		 2284 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  33.64 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 631 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 662 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 		 653 aa  69.3  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1832  DNA-binding response regulator  32.11 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.372268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1806  alkaline phosphatase synthesis response regulator  32.11 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000153503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2010  DNA-binding response regulator  32.11 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.93984e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1975  DNA-binding response regulator  32.11 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0483655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1847  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.29 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 		 876 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  33.1 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.23 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  30.84 
 
 		 121 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>