More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02240 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  652    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  84.57 
 
 		 344 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  43.81 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  33.53 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.55 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  33.64 
 
 		 334 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  33.64 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.82 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 331 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 331 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  31.96 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  30.84 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.45 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  35.4 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  32 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.66 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  35.49 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  34.47 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.72 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.89 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.8 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  30.77 
 
 		 344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  32.72 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  29.09 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  29.01 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  41.53 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 122 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 122 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 122 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  41.53 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 122 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  41.53 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  41.53 
 
 		 122 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 121 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  41.53 
 
 		 122 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  41.53 
 
 		 122 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  39.83 
 
 		 122 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  41.53 
 
 		 122 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  41.74 
 
 		 117 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 122 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 122 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  39.83 
 
 		 122 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  39.83 
 
 		 122 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  39.83 
 
 		 122 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  37.61 
 
 		 132 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  39.83 
 
 		 122 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  39.83 
 
 		 122 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 120 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  44.12 
 
 		 121 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  38.26 
 
 		 121 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  40.38 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.71 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  37.93 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  39.29 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 125 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 125 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  35 
 
 		 1066 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2214  protein-glutamate methylesterase  28.72 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2738  response regulator receiver domain-containing protein  39.81 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000186206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 737 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1847  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.19 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  30.77 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3003  two component Fis family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2439  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.06 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1770  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.74 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0433  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 1058 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2297  putative PAS/PAC sensor protein  34.51 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0617558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.51 
 
 		 620 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  34.13 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.16 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 968 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  36.45 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1532  protein-glutamate methylesterase  38.1 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1711  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.1 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1812  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.1 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00552618  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1975  DNA-binding response regulator  36.45 
 
 		 229 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0483655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 121 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  33.08 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>