More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4295 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  100 
 
 		 117 aa  236  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  52.14 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  48.72 
 
 		 331 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.72 
 
 		 331 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 331 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 331 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 331 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 331 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 331 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.15 
 
 		 331 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.86 
 
 		 335 aa  114  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  46.15 
 
 		 331 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.01 
 
 		 331 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  47.32 
 
 		 344 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  47.86 
 
 		 334 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.44 
 
 		 331 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  45.69 
 
 		 184 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  45.69 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  46.09 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  45.69 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  45.69 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.3 
 
 		 330 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  45.69 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.69 
 
 		 342 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  45.3 
 
 		 208 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  46.15 
 
 		 376 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  45.69 
 
 		 208 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  46.15 
 
 		 334 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.44 
 
 		 333 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  45.13 
 
 		 334 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  47.83 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  45.13 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  42.74 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  43.97 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  43.97 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  43.97 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  43.75 
 
 		 334 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 338 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  42.74 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 346 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  44.44 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  43.97 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  43.97 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  46.15 
 
 		 331 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  41.58 
 
 		 339 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  39.82 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  39.66 
 
 		 344 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  37.93 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  40 
 
 		 327 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 259 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1772  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1934  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808753  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2284  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0404  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  32.67 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2738  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000186206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  34.21 
 
 		 224 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 642 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 413 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 250 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0968  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 		 317 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.730939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 256 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2782  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 463 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6106  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2737  response regulator receiver domain-containing protein  31.19 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00154696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.53 
 
 		 1139 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  29.82 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3271  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>