More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6106 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6106  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  236  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0524  response regulator receiver protein  63.16 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0262  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.62327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 280 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4359  ATPase domain-containing protein  41 
 
 		 494 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  30.7 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1239  two component LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0482404  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  37.07 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3166  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 268 aa  76.6  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0613  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 391 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 655 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.748554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 216 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 223 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  35.09 
 
 		 272 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  33.33 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  33.05 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.54 
 
 		 205 aa  72  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 208 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3754  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 		 216 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00290124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0851  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0778308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0080  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.17 
 
 		 216 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  33.91 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 216 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 215 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 256 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  39.13 
 
 		 391 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 		 1648 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 247 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.58 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 		 217 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 228 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.17 
 
 		 215 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0202  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5556  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 255 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  35.4 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  31.9 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  31.9 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  31.9 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  36.21 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  31.9 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1431  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.578453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3507  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  31.9 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.21 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  28.07 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  33.93 
 
 		 595 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  30.17 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.17 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.9 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 548 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  31.03 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  30.36 
 
 		 597 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  33.04 
 
 		 595 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.82 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  33.62 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.36 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  30.77 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 595 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.03 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 534 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>