More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1392 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  68.48 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  66.54 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  64.2 
 
 		 256 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  64.4 
 
 		 256 aa  344  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  58.89 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  56.49 
 
 		 268 aa  316  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  57.03 
 
 		 269 aa  311  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.64 
 
 		 259 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.65 
 
 		 266 aa  311  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.83 
 
 		 288 aa  310  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  55.21 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  53.93 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  55.21 
 
 		 264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  55.21 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  55.21 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  55.21 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  55.21 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  55.21 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  55.21 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  55.6 
 
 		 259 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  55.21 
 
 		 276 aa  308  8e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  55.21 
 
 		 276 aa  307  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  51.29 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  54.51 
 
 		 276 aa  298  8e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  52.86 
 
 		 276 aa  295  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  53.1 
 
 		 266 aa  291  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  51.09 
 
 		 280 aa  285  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  53.88 
 
 		 262 aa  281  8.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  47.74 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  47.53 
 
 		 269 aa  259  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  38.22 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.02 
 
 		 222 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  35.54 
 
 		 1340 aa  85.9  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  36.36 
 
 		 1374 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2573  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0970392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.89 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  30.17 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.04 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  35 
 
 		 122 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  42.5 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6106  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  33.83 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  37.21 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  39.34 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.62 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  34.56 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.82 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  37.38 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  39.69 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  41.8 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  33.05 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.19 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  37.61 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  37.61 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  36 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  32.26 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  37.86 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.77 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  37.4 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  36.75 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  42.37 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  40.91 
 
 		 356 aa  75.5  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  30 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.91 
 
 		 509 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  35.1 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  35.1 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.9 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  35.1 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>