More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2335 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  100 
 
 		 411 aa  840    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  52.06 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  48.51 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1772  response regulator receiver protein  59.5 
 
 		 151 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0404  response regulator receiver protein  56.52 
 
 		 151 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0656  response regulator receiver protein  55.26 
 
 		 129 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2271  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 127 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.420434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  48.87 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0407  response regulator receiver protein  54.78 
 
 		 128 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627834  normal  0.12665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1769  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 129 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0324  response regulator receiver domain-containing protein  51.75 
 
 		 127 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  50.88 
 
 		 122 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2269  response regulator receiver protein  50 
 
 		 130 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.740525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 135 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 278 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 271 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 142 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 139 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 151 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1361  response regulator receiver protein  40.69 
 
 		 147 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  39.07 
 
 		 157 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0814  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 132 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 119 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 121 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 144 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2037  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 120 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 147 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0313  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 143 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0254543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2273  response regulator receiver protein  43.56 
 
 		 139 aa  94  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 456 aa  93.2  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2035  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 129 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1991  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 153 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1352  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 139 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00001959  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0314  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 131 aa  90.9  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0234873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 374 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1348  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 173 aa  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1566  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  36.76 
 
 		 272 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2039  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1358  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 144 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3404  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 455 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235439  normal  0.675632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0327  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 142 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0652  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 122 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.429078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1843  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.38 
 
 		 465 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.798265  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.5 
 
 		 448 aa  87  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 301 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.59 
 
 		 457 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3572  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0636  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 124 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 147 aa  87  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 256 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 653 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2737  response regulator receiver domain-containing protein  37.98 
 
 		 139 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00154696  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0018  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 135 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000218096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2720  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.52 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 688 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0993  DNA-binding response regulator OmpR  38.68 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0750  DNA-binding response regulator OmpR  38.68 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1574  DNA-binding response regulator OmpR  38.68 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0313  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.04 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0494225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01723  two-component system response regulator  36.13 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3023  DNA-binding response regulator OmpR  38.68 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0975164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0324  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.04 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.266606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0657  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.771795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 685 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0889  two component transcriptional regulator  37.74 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2405  two component transcriptional regulator  37.74 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343281  normal  0.0119317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1362  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 159 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1252  DNA-binding response regulator OmpR  37.74 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1099  DNA-binding response regulator  37.74 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  37.74 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0893  DNA-binding response regulator OmpR  37.74 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  37.74 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2541  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281957  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1094  DNA-binding response regulator  37.74 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1789  two component transcriptional regulator  37.74 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  37.74 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  37.74 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 137 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0668  nitrogen assimilation regulatory protein ntrX  36.03 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3717  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0302  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.32 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2549  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0150  response regulator receiver protein  43.08 
 
 		 134 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1804  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358984  normal  0.379225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1461  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0783973  normal  0.675596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 567 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>