40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2398 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  100 
 
 		 271 aa  555  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  50.2 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 413 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2397  hypothetical protein  28.79 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 411 aa  92.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  27.14 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  25.82 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  26.94 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  29.21 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  28.17 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  26.39 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  28.84 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  28.64 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  26.16 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  23.92 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  24.76 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  22.61 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2798  transport-associated  25.46 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549341  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  23.44 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  24.4 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  26.4 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  24.87 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  22.22 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  23.41 
 
 		 209 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  25.14 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  25.41 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  24.34 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  23.59 
 
 		 252 aa  45.4  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  24 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  23.75 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  23.9 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  23.12 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  24.24 
 
 		 473 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  23.37 
 
 		 184 aa  43.5  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  25.41 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  24.04 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  22.34 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  25.78 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  22.96 
 
 		 207 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  25.41 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>