26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4038 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  49.76 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  52.78 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  47.34 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  46.29 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  48.44 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  23.27 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  26.79 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  26.19 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  25.12 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  25.63 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  26.87 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  26.79 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  23.19 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  24.39 
 
 		 473 aa  58.9  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  30.26 
 
 		 428 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  27.4 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  21.72 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  22.34 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  28.85 
 
 		 273 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  23.9 
 
 		 271 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  19.8 
 
 		 310 aa  45.1  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  27.59 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  22.39 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  22.28 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  22.5 
 
 		 278 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>