24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0365 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  58.55 
 
 		 240 aa  254  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  53.88 
 
 		 209 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  51.14 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  57.47 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  48.44 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  27.27 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  28.7 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  21.72 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  26.43 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  21.52 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  24.68 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  26.01 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  25.68 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  24.54 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  24.55 
 
 		 473 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  23.29 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  27.35 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  24.66 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  25.23 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  25.23 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  26.11 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  24.53 
 
 		 201 aa  42  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>