44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1652 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  36.27 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  34.83 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  25.25 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  28.83 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  25.93 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  26.53 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  24.62 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  25 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  25.7 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  27.13 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  27.57 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  27.57 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  24.75 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  25.98 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  23.44 
 
 		 271 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  28.98 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  23.38 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  29.67 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  24.73 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  25.56 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  25.56 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  26.88 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  21.74 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  22.73 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  22.97 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  25.58 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  23.46 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  24.31 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  24.44 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  22.8 
 
 		 473 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  25.82 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  25.58 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  25.79 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  23.33 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  22.28 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  24.18 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  26.11 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  25.29 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  21.84 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  22.39 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  22.16 
 
 		 310 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  22.46 
 
 		 209 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>