52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0569 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  38.46 
 
 
207 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  35.71 
 
 
209 aa  144  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  38.31 
 
 
204 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  34.85 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  32.32 
 
 
473 aa  126  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  27.81 
 
 
428 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  27.27 
 
 
275 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  27.23 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  23.27 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  27.27 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  25 
 
 
275 aa  84.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  27.59 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  27.36 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  23.62 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  26.52 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  25.13 
 
 
271 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  25.13 
 
 
271 aa  72  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  24.24 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  21.95 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  28 
 
 
310 aa  68.6  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  25.53 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  24.4 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  21.72 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  24.62 
 
 
229 aa  63.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  23.81 
 
 
276 aa  61.2  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  24.34 
 
 
219 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  21.33 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  23.3 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  20.59 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  23.04 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  21.08 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  22.77 
 
 
252 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  22.28 
 
 
234 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  31.36 
 
 
180 aa  52  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  22.22 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  21.29 
 
 
259 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  22.53 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  22.53 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  23.65 
 
 
181 aa  48.9  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  21.32 
 
 
245 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  22.12 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  24.74 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  22.58 
 
 
234 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  23.27 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  19.62 
 
 
278 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  20.3 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  29.63 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  19.8 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  20.79 
 
 
236 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  24.86 
 
 
178 aa  42  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  25 
 
 
172 aa  41.6  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>