36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0009 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  26.79 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  26.55 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  27.44 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  26.1 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  25.99 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  25.48 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  27.34 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  26.38 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  29.21 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  26.97 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  27.36 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  28.04 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  27.55 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  27.09 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  25.53 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  22.66 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  28.42 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  28.33 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  29.51 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  28.44 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  31.25 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  26.02 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  25.79 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  22.55 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  27.75 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  25.41 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  24.44 
 
 		 413 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  26.37 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  20.9 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  23.47 
 
 		 406 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  26.89 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  21.84 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  22.28 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  24.42 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>