29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3706 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  43.08 
 
 
207 aa  166  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  39.2 
 
 
209 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  38.05 
 
 
201 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  38.31 
 
 
204 aa  142  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  35.38 
 
 
473 aa  121  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  33.68 
 
 
428 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  28.02 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  29 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  28.08 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  24.29 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  25.87 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  25.25 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  27.62 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  25.63 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  28.83 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  23.41 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  26.29 
 
 
271 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  26.92 
 
 
271 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  22.16 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  31.67 
 
 
276 aa  55.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  25.23 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  24.74 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  23.29 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  25.25 
 
 
231 aa  52  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  24.44 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  20.16 
 
 
252 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  23.23 
 
 
278 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  21.43 
 
 
271 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>