23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3885 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  417  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  64.22 
 
 
209 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  54.59 
 
 
209 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  57.47 
 
 
242 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  54.63 
 
 
240 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  53.24 
 
 
210 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  27.06 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  27.91 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  24.89 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  28.9 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  25.35 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  27.36 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  23.83 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  23.83 
 
 
473 aa  58.9  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  27.62 
 
 
201 aa  55.5  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  24.19 
 
 
271 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  21.15 
 
 
229 aa  48.5  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  18.52 
 
 
310 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  25.23 
 
 
238 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  25.47 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  23.36 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  29.1 
 
 
428 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  25.45 
 
 
238 aa  41.6  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>