28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0168 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  100 
 
 
310 aa  604  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0677  putative GAF sensor protein  54.46 
 
 
466 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000194317  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_655  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.46 
 
 
473 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00597549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0561  hypothetical protein  47.78 
 
 
249 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  22 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  27.86 
 
 
204 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  30.21 
 
 
214 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  21 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  23.66 
 
 
202 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  22.92 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  22.8 
 
 
252 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  21.9 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  21.5 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  21.43 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  20.3 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  23.76 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  20.31 
 
 
209 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  17.71 
 
 
209 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  23.2 
 
 
236 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  22.83 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  21.67 
 
 
209 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  23.2 
 
 
236 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  18.69 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  18.69 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  28.23 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  21.17 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  19.8 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  19.8 
 
 
234 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>