30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2332 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  59.57 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  59.83 
 
 		 234 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  58.55 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  49.35 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  44.02 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  44.44 
 
 		 234 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  46.32 
 
 		 231 aa  224  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  43.72 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  44.21 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  44.21 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  42.86 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  43.04 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  28.95 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  28.02 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  26.46 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  26.46 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  27.5 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  28.27 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  23.38 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  22.86 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  23.28 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  22.12 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  21.36 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  21.47 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  22.83 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  21.32 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  23.12 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  24.72 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  24.42 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>