39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3716 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  490  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  92.86 
 
 		 238 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  55.02 
 
 		 231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  46.44 
 
 		 236 aa  244  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  45.73 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  48.05 
 
 		 229 aa  235  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  46.15 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  52.23 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  44.4 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  42.92 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  44.4 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  44.21 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  43.29 
 
 		 236 aa  214  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  32.04 
 
 		 275 aa  98.2  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  27.89 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  27.08 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  27.89 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  23.15 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  25.95 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  28.42 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  26.84 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  28.08 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  21 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  24.62 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  22.82 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  20.59 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  24.58 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  25.49 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  21.39 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  24.31 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  23.9 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  24.61 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  25.53 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  20.49 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  22.34 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  27.03 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  24 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  23.66 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>