99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2809 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  66.67 
 
 		 273 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  69.6 
 
 		 271 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  68.5 
 
 		 271 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  63.97 
 
 		 273 aa  360  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  63 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  57.88 
 
 		 275 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  30 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  27.44 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  27.89 
 
 		 238 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2798  transport-associated  27.51 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549341  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  26.77 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  27.81 
 
 		 201 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  28.72 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  31.05 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  28.04 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  28.84 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  23.62 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  27.32 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  24.87 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  25.25 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  26.6 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  25.49 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2397  hypothetical protein  24.24 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  26.46 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  25.39 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  21.5 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  26.01 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  24.62 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  21.83 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  26.88 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  35.8 
 
 		 218 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  25.14 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  24.1 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  32.26 
 
 		 166 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  25.93 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  26.56 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  22.82 
 
 		 209 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  24.53 
 
 		 413 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  25 
 
 		 182 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  26.9 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  30.89 
 
 		 187 aa  49.3  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  25.26 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  34.92 
 
 		 127 aa  49.3  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  22.71 
 
 		 473 aa  48.9  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  29.07 
 
 		 184 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  31.37 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 104 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  32.35 
 
 		 104 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 104 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  31.03 
 
 		 104 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  25.13 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  32.14 
 
 		 171 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  32.14 
 
 		 171 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  30.88 
 
 		 103 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  28.85 
 
 		 210 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  32.88 
 
 		 202 aa  45.4  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  34.62 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  32.35 
 
 		 199 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  32.43 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  32.43 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  29.85 
 
 		 115 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  32.43 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  29.87 
 
 		 104 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  37.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  37.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  21.68 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  32.98 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  37.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  37.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  37.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  32.5 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  30.88 
 
 		 163 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0536  hypothetical protein  36.23 
 
 		 93 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  35.38 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  35.38 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  35.38 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  32.88 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  35.38 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  35.38 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  35.38 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  32.88 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  29.41 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  30.88 
 
 		 103 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  30.49 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  30.59 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  30.49 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  31.17 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  33.82 
 
 		 204 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  26.74 
 
 		 184 aa  42.7  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  30.88 
 
 		 112 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  30.56 
 
 		 104 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  30 
 
 		 158 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  27.62 
 
 		 192 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  26.32 
 
 		 180 aa  42.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>