123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0915 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  100 
 
 		 165 aa  323  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  55.49 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  47.4 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  42.07 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  42.07 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  37.93 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  36.77 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  32.68 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4115  transport-associated  44.14 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  38.96 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  47.14 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  43.48 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  43.48 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  42.5 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  41.18 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  43.75 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  40 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  33.04 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  43.21 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  46.38 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  41.18 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  38.03 
 
 		 103 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  40.58 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  38.24 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  36 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  39.13 
 
 		 104 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  38.03 
 
 		 199 aa  52  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  39.53 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  44.78 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  39.53 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  44.78 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  44.78 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  35.79 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  39.53 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  39.53 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  39.53 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  41.43 
 
 		 136 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  41.43 
 
 		 136 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  37.68 
 
 		 104 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  37.04 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  39.44 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  40.85 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  45.31 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  36.73 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  43.4 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  29.53 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  36.23 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  34.07 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  29.8 
 
 		 201 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  29.8 
 
 		 201 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  32.61 
 
 		 125 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  29.8 
 
 		 201 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  33.8 
 
 		 104 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  29.8 
 
 		 201 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  29.8 
 
 		 201 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  40 
 
 		 201 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  32.18 
 
 		 119 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  40 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  40 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  42.19 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  35.21 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  29.8 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 246 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  33.75 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  31.52 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  37.68 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  33.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  40 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  31.52 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  37.08 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  41.54 
 
 		 279 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  38.57 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  33.7 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  35.38 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  32.14 
 
 		 543 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  35.21 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  38.81 
 
 		 303 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  34.62 
 
 		 273 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  41.43 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  33.75 
 
 		 313 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  45.76 
 
 		 117 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  36.73 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  38.81 
 
 		 303 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  29.58 
 
 		 276 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  32.86 
 
 		 116 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  40 
 
 		 279 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  50 
 
 		 113 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  35.29 
 
 		 113 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0790  hypothetical protein  36.62 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  41.43 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  33.33 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  37.76 
 
 		 104 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  42.62 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  40.91 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  36.62 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  34.78 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  35.29 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>