210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01237 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  100 
 
 		 175 aa  333  9e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  56.52 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  60 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  54.22 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  60.37 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  62.25 
 
 		 184 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  61.59 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  61.59 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  56.97 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  61.59 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  61.59 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  56.1 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  60.93 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  50 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  35 
 
 		 276 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  35.22 
 
 		 222 aa  88.2  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  33.54 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  32.18 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  30.52 
 
 		 282 aa  77.4  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  31.65 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  35.22 
 
 		 275 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  32.41 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  31.51 
 
 		 273 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  34.52 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  30.82 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  31.51 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  33.12 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  31.01 
 
 		 204 aa  67.4  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  31.01 
 
 		 204 aa  67.4  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  31.01 
 
 		 204 aa  67.4  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  33.12 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  33.12 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  33.12 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  33.12 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  33.12 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  32.74 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  33.12 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  33.12 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  32.48 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  35.26 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  31.01 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  31.01 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  31.01 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  31.01 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  31.01 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  29.41 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  39.74 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  31.85 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  31.65 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  29.8 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  29.73 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  29.73 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  31.94 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  29.11 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  28.48 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  41.77 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  41.77 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  41.46 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  24.48 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  30.92 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  29.1 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  28.48 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  41.54 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  32.87 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  29.66 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  41.43 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  31.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  42.86 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0125  transport-associated  32.03 
 
 		 267 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  28.38 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  30.07 
 
 		 628 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  30.82 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  29.73 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  30.65 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  28.38 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  40.91 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  41.33 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  43.94 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  39.06 
 
 		 103 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  28.38 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  28.38 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  28.38 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  28.38 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  28.38 
 
 		 197 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  27.27 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  35.37 
 
 		 115 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1047  hypothetical protein  29.58 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  34 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  38.81 
 
 		 134 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  27.97 
 
 		 141 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  36.76 
 
 		 104 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  26.21 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  30.99 
 
 		 266 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  30.07 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0407  transport-associated  30.43 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  42.03 
 
 		 112 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  24.14 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  30.07 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  30.07 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  30.07 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>